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研究環境  Facilities

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研究室入口

手作り看板です(理研で主宰していたラボのメンバーからのプレゼント)。メッセージボードもあります。左はキーボックスです。

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PC作業環境

全員マルチディスプレイor大型ディスプレイです。机はなるべく幅120cmを確保するようにしています。

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移動式ワゴン

実験室では移動式のワゴンを使います。各自で一個ずつです。実験台の上を広々使えます。これはオススメです。

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タンパク質精製装置 

タンパク質精製装置AKTA startです。簡単に扱えます。主に大腸菌抽出液からの粗精製に使います。

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​試薬作製エリア

​試薬作製エリアです。電子天秤、pHメーター超音波破砕装置、電子レンジ、UV照射装置が置いてあります。

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製氷機と純水製造装置

製氷機と純水製造装置です。純水は器具洗浄用です。

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流し台付近

流し台付近。器具を洗ったり、乾燥させたりします。乾燥したらすぐに片付けましょう。

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クリーンベンチなど

クリーンベンチCO2インキュベーター冷蔵庫です。がん細胞株を培養したり、遺伝子導入実験をやったりします。自動セルカウンターを使います。奥に超低温フリーザーがあります。

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超純水製造装置など

超純水製造装置。2台あります。左奥に見えるのは、どこでもドラフトで、試薬作製時に粉塵が舞ったり、匂いが拡散したりを防ぎます。右側は培養細胞用の遠心機です。

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​イメージング装置

化学発光検出装置FUSION SOLO.

7S.EDGE。高感度です。ウエスタンブロットでの発光検出や、蛍光・透過光でのゲル撮影で使います。大活躍です。右下は簡易型のゲル撮影装置で、モニターとプリンタ付きです。

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リアルタイムPCRなど

リアルタイムPCR装置(左)と発光・蛍光・吸光マルチプレートリーダー(右)。遺伝子発現解析やタンパク質熱安定性解析を行なったり、酵素活性を測定します。

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高速冷却遠心機

高速冷却遠心機です。3台あります。1.5mL、15mL、50mL、8連チューブを遠心できます。

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​シェイカーとヒーターなど

シェイカーや、ローテーター、加熱・冷却装置。流しの上に板をはって置いてあります。

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小型実験機器

96ウェル加熱・冷却ミキサー、チューブミキサー、プレートシーラーナノドロップ(DNA, RNA, タンパク質の濃度測定)、プレート遠心機です。

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破砕装置と冷却装置

超音波破砕装置バイオラプターと冷却装置。冷やしながら超音波破砕ができます。

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サーマルサイクラー

サーマルサイクラー。加熱・冷却をプログラムして制御します。重宝しています。

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分子間相互作用解析装置

分子間相互作用解析装置BIACORE X-100です。化合物とタンパク質の結合を定量的に解析します。

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廊下にもホワイトボード

廊下のホワイトボード5枚です。ディスカッションや掲示で活躍中です。

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ワークステーション

ワークステーションです。画像処理や統計解析に使います。モニターはEIZOの32インチです。

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​機密書類の処分

シュレッダーです。

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​冷蔵庫の上

ネスプレッソが導入されました。

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ソファの上

ビーズクッションと大根です。

 その他研究施設  

​​基盤研究支援センター 機器分析支援部門・伊那分室

​超遠心分離機、蛍光顕微鏡などを利用できます。​詳細はリンク先をご覧ください。

​​基盤研究支援センター 機器分析支援部門・松本分室

様々な最先端の機器類を利用できます。詳細はリンク先をご覧ください。

​動物飼育・実験について

​農学部伊那キャンパス内の専用施設にて実施します。

 研究に役立つサイト  

統合TV:生命科学系DB・ツール使い倒し系チャンネル

BioTechnicalフォーラム:実験に困ったら投稿しよう。過去の投稿もすごく勉強になる。投稿前に過去トピを要チェック。

​▣ 綺麗なグラフを作ろう!

5分でできる! Excelでグラフを綺麗に書くコツ

伝わるデザイン [表とグラフ]

[Excel]論文向けのグラフを作るコツ

「先輩のExcelグラフ、ダサいですね」とデザイナーが言ってきたので教えを請うたら恋が始まった

ひと目で伝わる!グラフ作りの基本とデザインのコツ

確実に伝わる!見やすいプレゼン用グラフの作り方

Excelで棒グラフに個別のエラーバーをつける方法

Excelによるエラーバー(誤差範囲)付き棒グラフの作り方

エラーバー付き棒グラフをエクセルで作る

​▣ 画像解析・描写のフリーソフト

ImageJ:Javaプログラミング言語で書かれた画像解析ソフト

Fiji:ImageJに様々な機能が追加されたパッケージ

GIMP:多機能な画像編集・処理ソフト

INKSCAPE:ベクトル形式の画像を作成できる多機能なドローソフト

​▣ 化合物構造描写のフリーソフト

​化学構造式エディタまとめ

ChemSketch:分子構造描写ソフト

ChemDoodle:分子構造描写ソフト

Marvin:分子構造描写ソフト

​構造式を美しく書くために

​▣ 遺伝子配列解析のフリーソフト

ApE:プラスミドDNAのマップ作成ソフト

SnapGene Viewer:プラスミドDNAマップの描写ソフト

Enzyme X:制限酵素データベース(Only for Mac OS)

4Peaks:遺伝子配列解析ソフト(Only for Mac OS)

MEGA:複数の塩基配列やアミノ酸配列をアラインメント

Primer3:プライマー設計ソフト

​▣ タンパク質情報解析のフリーソフト

Scaffold:プロテオミクス解析ソフト(フリー版はデータ閲覧のみ)

UCSF CHIMERA:タンパク質立体構造の描写ソフト

CueMol2:タンパク質立体構造の描写ソフト(動作が軽い)

​▣ 統計解析

Rによる統計解析

R

Rのインストール

統計分析フリーソフト「R」

SAS University Edition

EZR (Easy R)

​▣ PDFファイルの編集

iLovePDF​:オンラインPDFツール

PDF compressor:オンラインPDF圧縮ツール

​▣ 英語論文執筆に役立つフリーソフトなど

Grammarly:英文・文法添削ツール

Mendeley:文献情報管理・リファレンスマネージャー

​ライフサイエンス辞書:生命科学系の辞書ツール

Google Scholar:学術文献を対象としたGoogle

Scrivener:文章執筆統合ソフト(有償) 他リンク(1, 2, 3)

​▣ Get Things Done (GTD)のためのフリーソフトなど

Stock:チームタスクの管理・共有ウェブツール

Toodledo:タスク管理ツール

TimeTree:スケジュール管理(Google Calendarと連携)

Evernote:メモアプリ

Gmailの受信箱を空にする!

​▣ ウェブ会議

Whereby:ブラウザ上で動く無料で簡単なウェブ会議システム

Zoom

Googleハングアウト

​▣ 研究不正防止

研究公正ポータル

研究者倫理:白楽ロックビル先生の記事

iThenticate:剽窃チェックツール

​▣ その他の便利情報

bitly:URL短縮サービス

ResearchGate:科学者・研究者向けのソーシャル・ネットワーク・サービス

ORCID:研究者の識別IDデータベース(論文を投稿する人は、IDを取得しましょう。)

Addgene:研究用プラスミドDNAを分与するNPO

PDB:タンパク質構造データの登録サイト

J-PlatPat:特許情報データベース

Patent Lens:特許情報データベース

​蛋白質科学会アーカイブ:タンパク質を使った実験技術が紹介されています。

 

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実験台

実験台は整理整頓して使いましょう。各実験台には小型の高速遠心機・ポルテックスミキサー・アスピレーター・電源装置を備えています。

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実験台と椅子

背もたれ付きの椅子はいいですね。

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ホワイトボード

実験室にホワイトボードがあります。廊下側の壁にも一面ホワイトボードをつけています。右端のはリアルタイムPCRです。

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​クールボックス

クールボックスです。氷要らずで便利です。

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培養装置とオートクレーブ

大型(左)と中型(中央)の大腸菌培養装置。大型だと10L培養できます。右はオートクレーブ

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オートクレーブとドラフト

オートクレーブとドラフトです。オートクレーブは試薬用と廃棄物用で2台あります。

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高速冷却遠心機

大型の高速冷却遠心機です。1Lボトルを4本回せます。大腸菌の回収が早くなりました。

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​恒温庫

ハイブリオーブン(左)と恒温培養槽(右)です。酵素反応とかに使います。

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タンパク質精製装置 

タンパク質精製装置AKTA pure 25です。パワフルです。でかいです。クロマトチャンバーの中に入っています。ゲルろ過、イオン交換、逆相など様々なカラムをセットします。

その他研究施設
研究に役立つサイト
研究環境
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